Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGT4

SUSD2, Sushi domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD2Q9UGT4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUSD2Q9UGT4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUSD2Q9UGT4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUSD2Q9UGT4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD2Q9UGT4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD2Q9UGT4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD2Q9UGT4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD2Q9UGT4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUSD2Q9UGT4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUSD2Q9UGT4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUSD2Q9UGT4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUSD2Q9UGT4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUSD2Q9UGT4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUSD2Q9UGT4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUSD2Q9UGT4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUSD2Q9UGT4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD2Q9UGT4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD2Q9UGT4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD2Q9UGT4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUSD2Q9UGT4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUSD2Q9UGT4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUSD2Q9UGT4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUSD2Q9UGT4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUSD2Q9UGT4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUSD2Q9UGT4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD2Q9UGT4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUSD2Q9UGT4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUSD2Q9UGT4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUSD2Q9UGT4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SUSD2Q9UGT4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD2Q9UGT4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD2Q9UGT4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD2Q9UGT4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD2Q9UGT4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD2Q9UGT4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD2Q9UGT4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD2Q9UGT4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD2Q9UGT4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD2Q9UGT4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD2Q9UGT4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD2Q9UGT4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SUSD2Q9UGT4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD2Q9UGT4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD2Q9UGT4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUSD2Q9UGT4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUSD2Q9UGT4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUSD2Q9UGT4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD2Q9UGT4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD2Q9UGT4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD2Q9UGT4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD2Q9UGT4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD2Q9UGT4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD2Q9UGT4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD2Q9UGT4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD2Q9UGT4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms