Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA9Q9UGM1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNA9Q9UGM1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA9Q9UGM1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA9Q9UGM1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA9Q9UGM1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA9Q9UGM1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA9Q9UGM1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA9Q9UGM1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA9Q9UGM1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA9Q9UGM1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA9Q9UGM1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA9Q9UGM1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA9Q9UGM1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA9Q9UGM1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA9Q9UGM1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA9Q9UGM1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA9Q9UGM1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA9Q9UGM1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRNA9Q9UGM1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms