Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPNE7Q9UBL6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPNE7Q9UBL6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPNE7Q9UBL6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPNE7Q9UBL6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPNE7Q9UBL6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPNE7Q9UBL6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPNE7Q9UBL6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPNE7Q9UBL6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPNE7Q9UBL6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPNE7Q9UBL6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPNE7Q9UBL6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPNE7Q9UBL6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPNE7Q9UBL6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPNE7Q9UBL6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CPNE7Q9UBL6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPNE7Q9UBL6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPNE7Q9UBL6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPNE7Q9UBL6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPNE7Q9UBL6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPNE7Q9UBL6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPNE7Q9UBL6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPNE7Q9UBL6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CPNE7Q9UBL6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPNE7Q9UBL6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPNE7Q9UBL6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPNE7Q9UBL6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPNE7Q9UBL6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPNE7Q9UBL6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPNE7Q9UBL6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPNE7Q9UBL6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPNE7Q9UBL6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPNE7Q9UBL6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPNE7Q9UBL6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPNE7Q9UBL6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPNE7Q9UBL6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPNE7Q9UBL6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPNE7Q9UBL6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPNE7Q9UBL6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPNE7Q9UBL6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPNE7Q9UBL6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPNE7Q9UBL6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPNE7Q9UBL6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPNE7Q9UBL6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPNE7Q9UBL6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPNE7Q9UBL6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPNE7Q9UBL6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPNE7Q9UBL6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPNE7Q9UBL6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPNE7Q9UBL6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPNE7Q9UBL6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPNE7Q9UBL6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPNE7Q9UBL6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPNE7Q9UBL6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPNE7Q9UBL6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CPNE7Q9UBL6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CPNE7Q9UBL6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPNE7Q9UBL6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CPNE7Q9UBL6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPNE7Q9UBL6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPNE7Q9UBL6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPNE7Q9UBL6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPNE7Q9UBL6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPNE7Q9UBL6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPNE7Q9UBL6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPNE7Q9UBL6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPNE7Q9UBL6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CPNE7Q9UBL6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CPNE7Q9UBL6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CPNE7Q9UBL6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPNE7Q9UBL6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPNE7Q9UBL6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPNE7Q9UBL6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CPNE7Q9UBL6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPNE7Q9UBL6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CPNE7Q9UBL6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPNE7Q9UBL6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPNE7Q9UBL6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPNE7Q9UBL6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPNE7Q9UBL6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms