Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COPG2Q9UBF2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COPG2Q9UBF2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COPG2Q9UBF2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COPG2Q9UBF2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COPG2Q9UBF2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COPG2Q9UBF2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPG2Q9UBF2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPG2Q9UBF2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPG2Q9UBF2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COPG2Q9UBF2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPG2Q9UBF2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPG2Q9UBF2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPG2Q9UBF2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPG2Q9UBF2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPG2Q9UBF2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPG2Q9UBF2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COPG2Q9UBF2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COPG2Q9UBF2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COPG2Q9UBF2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COPG2Q9UBF2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPG2Q9UBF2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPG2Q9UBF2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPG2Q9UBF2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPG2Q9UBF2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPG2Q9UBF2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPG2Q9UBF2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPG2Q9UBF2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
COPG2Q9UBF2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPG2Q9UBF2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPG2Q9UBF2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPG2Q9UBF2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPG2Q9UBF2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COPG2Q9UBF2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COPG2Q9UBF2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COPG2Q9UBF2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COPG2Q9UBF2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COPG2Q9UBF2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPG2Q9UBF2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPG2Q9UBF2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COPG2Q9UBF2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COPG2Q9UBF2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPG2Q9UBF2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPG2Q9UBF2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPG2Q9UBF2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPG2Q9UBF2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPG2Q9UBF2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPG2Q9UBF2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COPG2Q9UBF2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
COPG2Q9UBF2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COPG2Q9UBF2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPG2Q9UBF2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPG2Q9UBF2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COPG2Q9UBF2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COPG2Q9UBF2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COPG2Q9UBF2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPG2Q9UBF2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPG2Q9UBF2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPG2Q9UBF2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COPG2Q9UBF2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPG2Q9UBF2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COPG2Q9UBF2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms