Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
C9orf78Q9NZ63 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
C9orf78Q9NZ63 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
C9orf78Q9NZ63 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
C9orf78Q9NZ63 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
C9orf78Q9NZ63 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
C9orf78Q9NZ63 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
C9orf78Q9NZ63 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
C9orf78Q9NZ63 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
C9orf78Q9NZ63 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
C9orf78Q9NZ63 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
C9orf78Q9NZ63 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
C9orf78Q9NZ63 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
C9orf78Q9NZ63 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
C9orf78Q9NZ63 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
C9orf78Q9NZ63 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
C9orf78Q9NZ63 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
C9orf78Q9NZ63 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
C9orf78Q9NZ63 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
C9orf78Q9NZ63 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
C9orf78Q9NZ63 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
C9orf78Q9NZ63 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
C9orf78Q9NZ63 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
C9orf78Q9NZ63 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
C9orf78Q9NZ63 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
C9orf78Q9NZ63 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
C9orf78Q9NZ63 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
C9orf78Q9NZ63 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
C9orf78Q9NZ63 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
C9orf78Q9NZ63 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
C9orf78Q9NZ63 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
C9orf78Q9NZ63 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
C9orf78Q9NZ63 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
C9orf78Q9NZ63 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
C9orf78Q9NZ63 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
C9orf78Q9NZ63 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
C9orf78Q9NZ63 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
C9orf78Q9NZ63 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
C9orf78Q9NZ63 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
C9orf78Q9NZ63 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
C9orf78Q9NZ63 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
C9orf78Q9NZ63 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
C9orf78Q9NZ63 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
C9orf78Q9NZ63 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
C9orf78Q9NZ63 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
C9orf78Q9NZ63 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
C9orf78Q9NZ63 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
C9orf78Q9NZ63 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
C9orf78Q9NZ63 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
C9orf78Q9NZ63 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
C9orf78Q9NZ63 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
C9orf78Q9NZ63 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
C9orf78Q9NZ63 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
C9orf78Q9NZ63 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
C9orf78Q9NZ63 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
C9orf78Q9NZ63 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
C9orf78Q9NZ63 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
C9orf78Q9NZ63 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
C9orf78Q9NZ63 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
C9orf78Q9NZ63 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
C9orf78Q9NZ63 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
C9orf78Q9NZ63 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
C9orf78Q9NZ63 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
C9orf78Q9NZ63 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
C9orf78Q9NZ63 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
C9orf78Q9NZ63 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
C9orf78Q9NZ63 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
C9orf78Q9NZ63 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
C9orf78Q9NZ63 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
C9orf78Q9NZ63 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
C9orf78Q9NZ63 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
C9orf78Q9NZ63 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
C9orf78Q9NZ63 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
C9orf78Q9NZ63 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
C9orf78Q9NZ63 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
C9orf78Q9NZ63 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
C9orf78Q9NZ63 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
C9orf78Q9NZ63 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
C9orf78Q9NZ63 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
C9orf78Q9NZ63 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
C9orf78Q9NZ63 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
C9orf78Q9NZ63 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
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