Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH8Q9NYR8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH8Q9NYR8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH8Q9NYR8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH8Q9NYR8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH8Q9NYR8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH8Q9NYR8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH8Q9NYR8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH8Q9NYR8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH8Q9NYR8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH8Q9NYR8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH8Q9NYR8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH8Q9NYR8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDH8Q9NYR8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH8Q9NYR8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms