Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MTMR4Q9NYA4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MTMR4Q9NYA4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
MTMR4Q9NYA4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
MTMR4Q9NYA4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MTMR4Q9NYA4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MTMR4Q9NYA4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MTMR4Q9NYA4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MTMR4Q9NYA4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MTMR4Q9NYA4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MTMR4Q9NYA4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MTMR4Q9NYA4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MTMR4Q9NYA4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MTMR4Q9NYA4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MTMR4Q9NYA4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MTMR4Q9NYA4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MTMR4Q9NYA4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MTMR4Q9NYA4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MTMR4Q9NYA4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MTMR4Q9NYA4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MTMR4Q9NYA4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
MTMR4Q9NYA4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MTMR4Q9NYA4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MTMR4Q9NYA4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MTMR4Q9NYA4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MTMR4Q9NYA4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MTMR4Q9NYA4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MTMR4Q9NYA4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MTMR4Q9NYA4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MTMR4Q9NYA4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MTMR4Q9NYA4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MTMR4Q9NYA4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MTMR4Q9NYA4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MTMR4Q9NYA4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MTMR4Q9NYA4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MTMR4Q9NYA4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MTMR4Q9NYA4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MTMR4Q9NYA4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MTMR4Q9NYA4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MTMR4Q9NYA4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MTMR4Q9NYA4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MTMR4Q9NYA4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MTMR4Q9NYA4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MTMR4Q9NYA4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MTMR4Q9NYA4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
MTMR4Q9NYA4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MTMR4Q9NYA4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MTMR4Q9NYA4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
MTMR4Q9NYA4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
MTMR4Q9NYA4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MTMR4Q9NYA4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MTMR4Q9NYA4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
MTMR4Q9NYA4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
MTMR4Q9NYA4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
MTMR4Q9NYA4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MTMR4Q9NYA4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
MTMR4Q9NYA4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
MTMR4Q9NYA4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MTMR4Q9NYA4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
MTMR4Q9NYA4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
MTMR4Q9NYA4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MTMR4Q9NYA4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MTMR4Q9NYA4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
MTMR4Q9NYA4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
MTMR4Q9NYA4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MTMR4Q9NYA4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MTMR4Q9NYA4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MTMR4Q9NYA4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MTMR4Q9NYA4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MTMR4Q9NYA4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MTMR4Q9NYA4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
MTMR4Q9NYA4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
MTMR4Q9NYA4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
MTMR4Q9NYA4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MTMR4Q9NYA4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MTMR4Q9NYA4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
MTMR4Q9NYA4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MTMR4Q9NYA4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MTMR4Q9NYA4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MTMR4Q9NYA4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MTMR4Q9NYA4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MTMR4Q9NYA4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MTMR4Q9NYA4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MTMR4Q9NYA4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MTMR4Q9NYA4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MTMR4Q9NYA4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MTMR4Q9NYA4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MTMR4Q9NYA4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MTMR4Q9NYA4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MTMR4Q9NYA4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
MTMR4Q9NYA4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
MTMR4Q9NYA4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MTMR4Q9NYA4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
MTMR4Q9NYA4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MTMR4Q9NYA4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MTMR4Q9NYA4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MTMR4Q9NYA4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MTMR4Q9NYA4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MTMR4Q9NYA4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
MTMR4Q9NYA4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193 ms