Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBQLN4Q9NRR5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBQLN4Q9NRR5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBQLN4Q9NRR5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBQLN4Q9NRR5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms