Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH3

TUBG2, Tubulin gamma-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG2Q9NRH3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBG2Q9NRH3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBG2Q9NRH3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBG2Q9NRH3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBG2Q9NRH3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBG2Q9NRH3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBG2Q9NRH3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBG2Q9NRH3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBG2Q9NRH3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBG2Q9NRH3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBG2Q9NRH3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBG2Q9NRH3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBG2Q9NRH3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBG2Q9NRH3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBG2Q9NRH3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBG2Q9NRH3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBG2Q9NRH3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBG2Q9NRH3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBG2Q9NRH3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBG2Q9NRH3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBG2Q9NRH3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBG2Q9NRH3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBG2Q9NRH3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBG2Q9NRH3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBG2Q9NRH3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBG2Q9NRH3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBG2Q9NRH3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBG2Q9NRH3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBG2Q9NRH3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBG2Q9NRH3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBG2Q9NRH3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms