Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SNRKQ9NRH2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SNRKQ9NRH2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SNRKQ9NRH2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SNRKQ9NRH2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SNRKQ9NRH2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SNRKQ9NRH2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SNRKQ9NRH2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SNRKQ9NRH2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SNRKQ9NRH2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SNRKQ9NRH2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SNRKQ9NRH2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SNRKQ9NRH2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SNRKQ9NRH2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SNRKQ9NRH2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SNRKQ9NRH2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SNRKQ9NRH2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SNRKQ9NRH2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SNRKQ9NRH2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SNRKQ9NRH2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SNRKQ9NRH2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SNRKQ9NRH2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SNRKQ9NRH2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SNRKQ9NRH2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SNRKQ9NRH2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SNRKQ9NRH2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SNRKQ9NRH2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SNRKQ9NRH2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SNRKQ9NRH2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SNRKQ9NRH2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SNRKQ9NRH2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SNRKQ9NRH2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SNRKQ9NRH2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SNRKQ9NRH2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SNRKQ9NRH2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SNRKQ9NRH2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SNRKQ9NRH2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SNRKQ9NRH2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SNRKQ9NRH2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SNRKQ9NRH2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SNRKQ9NRH2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SNRKQ9NRH2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SNRKQ9NRH2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SNRKQ9NRH2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SNRKQ9NRH2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SNRKQ9NRH2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SNRKQ9NRH2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SNRKQ9NRH2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SNRKQ9NRH2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SNRKQ9NRH2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SNRKQ9NRH2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SNRKQ9NRH2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SNRKQ9NRH2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SNRKQ9NRH2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SNRKQ9NRH2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SNRKQ9NRH2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SNRKQ9NRH2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SNRKQ9NRH2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SNRKQ9NRH2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SNRKQ9NRH2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SNRKQ9NRH2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SNRKQ9NRH2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SNRKQ9NRH2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SNRKQ9NRH2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
SNRKQ9NRH2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SNRKQ9NRH2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SNRKQ9NRH2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SNRKQ9NRH2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SNRKQ9NRH2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SNRKQ9NRH2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SNRKQ9NRH2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SNRKQ9NRH2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SNRKQ9NRH2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SNRKQ9NRH2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
SNRKQ9NRH2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SNRKQ9NRH2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SNRKQ9NRH2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SNRKQ9NRH2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SNRKQ9NRH2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SNRKQ9NRH2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SNRKQ9NRH2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SNRKQ9NRH2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SNRKQ9NRH2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms