Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BATF3Q9NR55 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BATF3Q9NR55 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BATF3Q9NR55 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BATF3Q9NR55 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BATF3Q9NR55 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BATF3Q9NR55 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BATF3Q9NR55 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BATF3Q9NR55 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BATF3Q9NR55 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BATF3Q9NR55 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BATF3Q9NR55 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BATF3Q9NR55 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BATF3Q9NR55 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BATF3Q9NR55 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BATF3Q9NR55 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BATF3Q9NR55 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BATF3Q9NR55 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BATF3Q9NR55 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BATF3Q9NR55 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BATF3Q9NR55 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BATF3Q9NR55 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BATF3Q9NR55 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BATF3Q9NR55 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BATF3Q9NR55 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BATF3Q9NR55 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BATF3Q9NR55 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BATF3Q9NR55 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BATF3Q9NR55 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BATF3Q9NR55 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BATF3Q9NR55 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BATF3Q9NR55 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BATF3Q9NR55 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BATF3Q9NR55 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BATF3Q9NR55 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BATF3Q9NR55 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BATF3Q9NR55 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BATF3Q9NR55 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BATF3Q9NR55 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BATF3Q9NR55 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BATF3Q9NR55 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
BATF3Q9NR55 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BATF3Q9NR55 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BATF3Q9NR55 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BATF3Q9NR55 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BATF3Q9NR55 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BATF3Q9NR55 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BATF3Q9NR55 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BATF3Q9NR55 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BATF3Q9NR55 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BATF3Q9NR55 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BATF3Q9NR55 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BATF3Q9NR55 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BATF3Q9NR55 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BATF3Q9NR55 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BATF3Q9NR55 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BATF3Q9NR55 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BATF3Q9NR55 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BATF3Q9NR55 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BATF3Q9NR55 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BATF3Q9NR55 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BATF3Q9NR55 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BATF3Q9NR55 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BATF3Q9NR55 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BATF3Q9NR55 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BATF3Q9NR55 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BATF3Q9NR55 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BATF3Q9NR55 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BATF3Q9NR55 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BATF3Q9NR55 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms