Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACKR4Q9NPB9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACKR4Q9NPB9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACKR4Q9NPB9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACKR4Q9NPB9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACKR4Q9NPB9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACKR4Q9NPB9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACKR4Q9NPB9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACKR4Q9NPB9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACKR4Q9NPB9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACKR4Q9NPB9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACKR4Q9NPB9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACKR4Q9NPB9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACKR4Q9NPB9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACKR4Q9NPB9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACKR4Q9NPB9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACKR4Q9NPB9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACKR4Q9NPB9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACKR4Q9NPB9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACKR4Q9NPB9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACKR4Q9NPB9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACKR4Q9NPB9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACKR4Q9NPB9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACKR4Q9NPB9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACKR4Q9NPB9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACKR4Q9NPB9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACKR4Q9NPB9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACKR4Q9NPB9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACKR4Q9NPB9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACKR4Q9NPB9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACKR4Q9NPB9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACKR4Q9NPB9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACKR4Q9NPB9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACKR4Q9NPB9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACKR4Q9NPB9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACKR4Q9NPB9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACKR4Q9NPB9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACKR4Q9NPB9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACKR4Q9NPB9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACKR4Q9NPB9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACKR4Q9NPB9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACKR4Q9NPB9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACKR4Q9NPB9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACKR4Q9NPB9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACKR4Q9NPB9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACKR4Q9NPB9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACKR4Q9NPB9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACKR4Q9NPB9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms