Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB9Q9NP78 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB9Q9NP78 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB9Q9NP78 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB9Q9NP78 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB9Q9NP78 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB9Q9NP78 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB9Q9NP78 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB9Q9NP78 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB9Q9NP78 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB9Q9NP78 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB9Q9NP78 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB9Q9NP78 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB9Q9NP78 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB9Q9NP78 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCB9Q9NP78 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB9Q9NP78 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB9Q9NP78 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB9Q9NP78 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB9Q9NP78 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB9Q9NP78 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB9Q9NP78 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB9Q9NP78 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB9Q9NP78 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB9Q9NP78 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB9Q9NP78 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB9Q9NP78 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB9Q9NP78 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB9Q9NP78 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB9Q9NP78 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB9Q9NP78 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB9Q9NP78 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB9Q9NP78 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB9Q9NP78 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB9Q9NP78 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB9Q9NP78 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB9Q9NP78 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB9Q9NP78 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB9Q9NP78 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB9Q9NP78 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB9Q9NP78 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB9Q9NP78 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB9Q9NP78 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB9Q9NP78 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB9Q9NP78 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB9Q9NP78 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB9Q9NP78 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB9Q9NP78 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB9Q9NP78 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB9Q9NP78 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB9Q9NP78 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB9Q9NP78 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB9Q9NP78 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB9Q9NP78 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB9Q9NP78 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB9Q9NP78 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB9Q9NP78 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB9Q9NP78 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB9Q9NP78 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB9Q9NP78 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB9Q9NP78 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB9Q9NP78 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB9Q9NP78 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB9Q9NP78 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB9Q9NP78 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms