Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAC7

SUGCT, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGCTQ9HAC7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SUGCTQ9HAC7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SUGCTQ9HAC7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SUGCTQ9HAC7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SUGCTQ9HAC7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SUGCTQ9HAC7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SUGCTQ9HAC7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SUGCTQ9HAC7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SUGCTQ9HAC7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SUGCTQ9HAC7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SUGCTQ9HAC7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SUGCTQ9HAC7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SUGCTQ9HAC7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SUGCTQ9HAC7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SUGCTQ9HAC7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SUGCTQ9HAC7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SUGCTQ9HAC7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SUGCTQ9HAC7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SUGCTQ9HAC7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SUGCTQ9HAC7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SUGCTQ9HAC7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SUGCTQ9HAC7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SUGCTQ9HAC7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SUGCTQ9HAC7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SUGCTQ9HAC7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SUGCTQ9HAC7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SUGCTQ9HAC7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SUGCTQ9HAC7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SUGCTQ9HAC7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SUGCTQ9HAC7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SUGCTQ9HAC7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SUGCTQ9HAC7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUGCTQ9HAC7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUGCTQ9HAC7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SUGCTQ9HAC7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUGCTQ9HAC7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUGCTQ9HAC7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SUGCTQ9HAC7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SUGCTQ9HAC7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUGCTQ9HAC7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUGCTQ9HAC7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUGCTQ9HAC7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUGCTQ9HAC7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUGCTQ9HAC7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUGCTQ9HAC7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUGCTQ9HAC7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUGCTQ9HAC7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SUGCTQ9HAC7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SUGCTQ9HAC7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SUGCTQ9HAC7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SUGCTQ9HAC7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SUGCTQ9HAC7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUGCTQ9HAC7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUGCTQ9HAC7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUGCTQ9HAC7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUGCTQ9HAC7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SUGCTQ9HAC7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SUGCTQ9HAC7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SUGCTQ9HAC7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SUGCTQ9HAC7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SUGCTQ9HAC7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SUGCTQ9HAC7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SUGCTQ9HAC7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SUGCTQ9HAC7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SUGCTQ9HAC7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SUGCTQ9HAC7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SUGCTQ9HAC7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SUGCTQ9HAC7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SUGCTQ9HAC7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SUGCTQ9HAC7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SUGCTQ9HAC7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SUGCTQ9HAC7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SUGCTQ9HAC7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SUGCTQ9HAC7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SUGCTQ9HAC7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SUGCTQ9HAC7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SUGCTQ9HAC7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SUGCTQ9HAC7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SUGCTQ9HAC7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SUGCTQ9HAC7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SUGCTQ9HAC7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SUGCTQ9HAC7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms