Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I2

ZHX3, Zinc fingers and homeoboxes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZHX3Q9H4I2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZHX3Q9H4I2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZHX3Q9H4I2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZHX3Q9H4I2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZHX3Q9H4I2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZHX3Q9H4I2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZHX3Q9H4I2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZHX3Q9H4I2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ZHX3Q9H4I2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZHX3Q9H4I2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZHX3Q9H4I2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZHX3Q9H4I2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZHX3Q9H4I2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZHX3Q9H4I2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ZHX3Q9H4I2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZHX3Q9H4I2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZHX3Q9H4I2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZHX3Q9H4I2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZHX3Q9H4I2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZHX3Q9H4I2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZHX3Q9H4I2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZHX3Q9H4I2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZHX3Q9H4I2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZHX3Q9H4I2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZHX3Q9H4I2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZHX3Q9H4I2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZHX3Q9H4I2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZHX3Q9H4I2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZHX3Q9H4I2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZHX3Q9H4I2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZHX3Q9H4I2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZHX3Q9H4I2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZHX3Q9H4I2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZHX3Q9H4I2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZHX3Q9H4I2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZHX3Q9H4I2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZHX3Q9H4I2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZHX3Q9H4I2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZHX3Q9H4I2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZHX3Q9H4I2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZHX3Q9H4I2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZHX3Q9H4I2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZHX3Q9H4I2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZHX3Q9H4I2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZHX3Q9H4I2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ZHX3Q9H4I2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZHX3Q9H4I2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZHX3Q9H4I2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ZHX3Q9H4I2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZHX3Q9H4I2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZHX3Q9H4I2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ZHX3Q9H4I2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZHX3Q9H4I2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZHX3Q9H4I2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZHX3Q9H4I2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZHX3Q9H4I2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZHX3Q9H4I2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZHX3Q9H4I2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms