Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SEMA6BQ9H3T3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEMA6BQ9H3T3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEMA6BQ9H3T3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SEMA6BQ9H3T3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SEMA6BQ9H3T3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SEMA6BQ9H3T3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SEMA6BQ9H3T3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SEMA6BQ9H3T3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SEMA6BQ9H3T3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SEMA6BQ9H3T3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SEMA6BQ9H3T3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEMA6BQ9H3T3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEMA6BQ9H3T3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEMA6BQ9H3T3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEMA6BQ9H3T3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SEMA6BQ9H3T3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SEMA6BQ9H3T3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SEMA6BQ9H3T3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SEMA6BQ9H3T3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEMA6BQ9H3T3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEMA6BQ9H3T3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEMA6BQ9H3T3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEMA6BQ9H3T3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEMA6BQ9H3T3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEMA6BQ9H3T3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEMA6BQ9H3T3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEMA6BQ9H3T3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEMA6BQ9H3T3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEMA6BQ9H3T3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEMA6BQ9H3T3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEMA6BQ9H3T3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEMA6BQ9H3T3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEMA6BQ9H3T3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SEMA6BQ9H3T3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SEMA6BQ9H3T3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SEMA6BQ9H3T3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SEMA6BQ9H3T3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEMA6BQ9H3T3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms