Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMUB1Q9BVT8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMUB1Q9BVT8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMUB1Q9BVT8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMUB1Q9BVT8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMUB1Q9BVT8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMUB1Q9BVT8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMUB1Q9BVT8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMUB1Q9BVT8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMUB1Q9BVT8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMUB1Q9BVT8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMUB1Q9BVT8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMUB1Q9BVT8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMUB1Q9BVT8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMUB1Q9BVT8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMUB1Q9BVT8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMUB1Q9BVT8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMUB1Q9BVT8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMUB1Q9BVT8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMUB1Q9BVT8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMUB1Q9BVT8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMUB1Q9BVT8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMUB1Q9BVT8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMUB1Q9BVT8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMUB1Q9BVT8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMUB1Q9BVT8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMUB1Q9BVT8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMUB1Q9BVT8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMUB1Q9BVT8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMUB1Q9BVT8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMUB1Q9BVT8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMUB1Q9BVT8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMUB1Q9BVT8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMUB1Q9BVT8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMUB1Q9BVT8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms