Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIMD2Q9BT23 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIMD2Q9BT23 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIMD2Q9BT23 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms