Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YIPF4Q9BSR8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YIPF4Q9BSR8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YIPF4Q9BSR8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YIPF4Q9BSR8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YIPF4Q9BSR8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YIPF4Q9BSR8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YIPF4Q9BSR8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YIPF4Q9BSR8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
YIPF4Q9BSR8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YIPF4Q9BSR8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YIPF4Q9BSR8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YIPF4Q9BSR8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YIPF4Q9BSR8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YIPF4Q9BSR8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF4Q9BSR8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF4Q9BSR8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF4Q9BSR8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF4Q9BSR8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YIPF4Q9BSR8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YIPF4Q9BSR8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YIPF4Q9BSR8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YIPF4Q9BSR8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF4Q9BSR8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF4Q9BSR8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF4Q9BSR8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF4Q9BSR8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF4Q9BSR8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF4Q9BSR8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF4Q9BSR8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF4Q9BSR8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF4Q9BSR8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF4Q9BSR8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YIPF4Q9BSR8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF4Q9BSR8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF4Q9BSR8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF4Q9BSR8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YIPF4Q9BSR8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YIPF4Q9BSR8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YIPF4Q9BSR8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.2 ms