Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF1Q9BSM1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PCGF1Q9BSM1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF1Q9BSM1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCGF1Q9BSM1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms