Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT9

GINS4, DNA replication complex GINS protein SLD5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS4Q9BRT9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINS4Q9BRT9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINS4Q9BRT9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS4Q9BRT9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS4Q9BRT9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS4Q9BRT9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS4Q9BRT9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS4Q9BRT9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS4Q9BRT9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS4Q9BRT9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS4Q9BRT9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS4Q9BRT9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GINS4Q9BRT9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GINS4Q9BRT9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINS4Q9BRT9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GINS4Q9BRT9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS4Q9BRT9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS4Q9BRT9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS4Q9BRT9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS4Q9BRT9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS4Q9BRT9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS4Q9BRT9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS4Q9BRT9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS4Q9BRT9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS4Q9BRT9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS4Q9BRT9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS4Q9BRT9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS4Q9BRT9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS4Q9BRT9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS4Q9BRT9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS4Q9BRT9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS4Q9BRT9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms