Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LITAFQ99732 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LITAFQ99732 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LITAFQ99732 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LITAFQ99732 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LITAFQ99732 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LITAFQ99732 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LITAFQ99732 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LITAFQ99732 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LITAFQ99732 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LITAFQ99732 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LITAFQ99732 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LITAFQ99732 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LITAFQ99732 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LITAFQ99732 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LITAFQ99732 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LITAFQ99732 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LITAFQ99732 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms