Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VAT1Q99536 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAT1Q99536 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VAT1Q99536 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAT1Q99536 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAT1Q99536 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAT1Q99536 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAT1Q99536 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAT1Q99536 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAT1Q99536 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAT1Q99536 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAT1Q99536 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAT1Q99536 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAT1Q99536 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAT1Q99536 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAT1Q99536 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAT1Q99536 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAT1Q99536 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAT1Q99536 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VAT1Q99536 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAT1Q99536 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAT1Q99536 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VAT1Q99536 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAT1Q99536 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAT1Q99536 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAT1Q99536 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAT1Q99536 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAT1Q99536 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAT1Q99536 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAT1Q99536 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAT1Q99536 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAT1Q99536 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAT1Q99536 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAT1Q99536 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAT1Q99536 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAT1Q99536 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms