Protein–RNA interactions for Protein: Q99436

PSMB7, Proteasome subunit beta type-7, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB7Q99436 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMB7Q99436 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMB7Q99436 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMB7Q99436 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PSMB7Q99436 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSMB7Q99436 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMB7Q99436 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMB7Q99436 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMB7Q99436 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMB7Q99436 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMB7Q99436 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMB7Q99436 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMB7Q99436 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMB7Q99436 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMB7Q99436 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMB7Q99436 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMB7Q99436 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMB7Q99436 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMB7Q99436 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMB7Q99436 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMB7Q99436 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMB7Q99436 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMB7Q99436 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMB7Q99436 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMB7Q99436 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMB7Q99436 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMB7Q99436 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMB7Q99436 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMB7Q99436 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMB7Q99436 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PSMB7Q99436 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSMB7Q99436 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMB7Q99436 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMB7Q99436 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMB7Q99436 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMB7Q99436 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMB7Q99436 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMB7Q99436 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMB7Q99436 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMB7Q99436 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMB7Q99436 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMB7Q99436 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMB7Q99436 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMB7Q99436 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMB7Q99436 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms