Protein–RNA interactions for Protein: Q99217

AMELX, Amelogenin, X isoform, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMELXQ99217 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMELXQ99217 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AMELXQ99217 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMELXQ99217 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMELXQ99217 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms