Protein–RNA interactions for Protein: Q96T21

SECISBP2, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECISBP2Q96T21 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SECISBP2Q96T21 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SECISBP2Q96T21 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SECISBP2Q96T21 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SECISBP2Q96T21 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SECISBP2Q96T21 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SECISBP2Q96T21 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SECISBP2Q96T21 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SECISBP2Q96T21 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SECISBP2Q96T21 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SECISBP2Q96T21 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SECISBP2Q96T21 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SECISBP2Q96T21 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SECISBP2Q96T21 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SECISBP2Q96T21 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SECISBP2Q96T21 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SECISBP2Q96T21 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SECISBP2Q96T21 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SECISBP2Q96T21 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SECISBP2Q96T21 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms