Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
SIN3AQ96ST3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SIN3AQ96ST3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SIN3AQ96ST3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SIN3AQ96ST3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SIN3AQ96ST3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SIN3AQ96ST3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SIN3AQ96ST3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SIN3AQ96ST3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SIN3AQ96ST3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SIN3AQ96ST3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SIN3AQ96ST3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SIN3AQ96ST3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SIN3AQ96ST3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SIN3AQ96ST3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SIN3AQ96ST3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SIN3AQ96ST3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SIN3AQ96ST3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SIN3AQ96ST3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SIN3AQ96ST3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SIN3AQ96ST3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SIN3AQ96ST3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SIN3AQ96ST3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SIN3AQ96ST3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SIN3AQ96ST3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SIN3AQ96ST3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SIN3AQ96ST3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SIN3AQ96ST3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SIN3AQ96ST3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SIN3AQ96ST3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SIN3AQ96ST3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
SIN3AQ96ST3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
SIN3AQ96ST3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SIN3AQ96ST3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SIN3AQ96ST3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SIN3AQ96ST3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SIN3AQ96ST3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SIN3AQ96ST3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SIN3AQ96ST3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
SIN3AQ96ST3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SIN3AQ96ST3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SIN3AQ96ST3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
SIN3AQ96ST3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SIN3AQ96ST3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SIN3AQ96ST3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SIN3AQ96ST3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SIN3AQ96ST3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SIN3AQ96ST3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SIN3AQ96ST3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SIN3AQ96ST3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SIN3AQ96ST3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SIN3AQ96ST3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SIN3AQ96ST3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SIN3AQ96ST3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SIN3AQ96ST3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SIN3AQ96ST3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SIN3AQ96ST3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SIN3AQ96ST3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SIN3AQ96ST3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SIN3AQ96ST3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SIN3AQ96ST3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SIN3AQ96ST3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SIN3AQ96ST3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SIN3AQ96ST3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SIN3AQ96ST3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SIN3AQ96ST3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
SIN3AQ96ST3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SIN3AQ96ST3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SIN3AQ96ST3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SIN3AQ96ST3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SIN3AQ96ST3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SIN3AQ96ST3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SIN3AQ96ST3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SIN3AQ96ST3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SIN3AQ96ST3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SIN3AQ96ST3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
SIN3AQ96ST3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SIN3AQ96ST3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
SIN3AQ96ST3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SIN3AQ96ST3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
SIN3AQ96ST3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
SIN3AQ96ST3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SIN3AQ96ST3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SIN3AQ96ST3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SIN3AQ96ST3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SIN3AQ96ST3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SIN3AQ96ST3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SIN3AQ96ST3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SIN3AQ96ST3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
SIN3AQ96ST3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SIN3AQ96ST3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SIN3AQ96ST3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
SIN3AQ96ST3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
SIN3AQ96ST3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SIN3AQ96ST3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SIN3AQ96ST3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SIN3AQ96ST3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SIN3AQ96ST3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SIN3AQ96ST3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SIN3AQ96ST3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms