Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT3

GUCD1, Protein GUCD1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GUCD1Q96NT3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GUCD1Q96NT3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GUCD1Q96NT3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GUCD1Q96NT3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GUCD1Q96NT3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GUCD1Q96NT3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GUCD1Q96NT3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GUCD1Q96NT3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GUCD1Q96NT3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GUCD1Q96NT3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GUCD1Q96NT3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GUCD1Q96NT3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GUCD1Q96NT3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GUCD1Q96NT3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GUCD1Q96NT3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GUCD1Q96NT3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GUCD1Q96NT3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GUCD1Q96NT3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GUCD1Q96NT3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GUCD1Q96NT3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GUCD1Q96NT3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GUCD1Q96NT3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GUCD1Q96NT3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GUCD1Q96NT3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GUCD1Q96NT3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GUCD1Q96NT3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GUCD1Q96NT3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GUCD1Q96NT3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GUCD1Q96NT3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GUCD1Q96NT3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GUCD1Q96NT3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GUCD1Q96NT3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GUCD1Q96NT3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GUCD1Q96NT3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GUCD1Q96NT3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GUCD1Q96NT3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GUCD1Q96NT3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GUCD1Q96NT3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GUCD1Q96NT3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GUCD1Q96NT3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GUCD1Q96NT3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GUCD1Q96NT3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GUCD1Q96NT3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GUCD1Q96NT3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GUCD1Q96NT3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GUCD1Q96NT3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GUCD1Q96NT3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GUCD1Q96NT3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GUCD1Q96NT3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GUCD1Q96NT3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GUCD1Q96NT3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GUCD1Q96NT3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GUCD1Q96NT3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GUCD1Q96NT3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GUCD1Q96NT3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GUCD1Q96NT3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GUCD1Q96NT3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GUCD1Q96NT3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GUCD1Q96NT3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GUCD1Q96NT3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GUCD1Q96NT3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GUCD1Q96NT3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GUCD1Q96NT3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GUCD1Q96NT3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GUCD1Q96NT3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GUCD1Q96NT3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GUCD1Q96NT3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GUCD1Q96NT3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GUCD1Q96NT3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GUCD1Q96NT3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GUCD1Q96NT3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GUCD1Q96NT3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GUCD1Q96NT3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GUCD1Q96NT3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GUCD1Q96NT3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GUCD1Q96NT3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GUCD1Q96NT3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GUCD1Q96NT3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GUCD1Q96NT3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GUCD1Q96NT3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GUCD1Q96NT3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GUCD1Q96NT3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GUCD1Q96NT3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GUCD1Q96NT3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GUCD1Q96NT3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GUCD1Q96NT3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GUCD1Q96NT3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GUCD1Q96NT3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GUCD1Q96NT3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GUCD1Q96NT3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GUCD1Q96NT3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GUCD1Q96NT3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GUCD1Q96NT3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GUCD1Q96NT3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GUCD1Q96NT3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GUCD1Q96NT3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GUCD1Q96NT3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GUCD1Q96NT3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GUCD1Q96NT3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GUCD1Q96NT3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms