Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR1

ZFR, Zinc finger RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFRQ96KR1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZFRQ96KR1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZFRQ96KR1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZFRQ96KR1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZFRQ96KR1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZFRQ96KR1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ZFRQ96KR1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZFRQ96KR1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZFRQ96KR1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZFRQ96KR1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZFRQ96KR1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZFRQ96KR1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZFRQ96KR1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZFRQ96KR1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZFRQ96KR1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZFRQ96KR1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZFRQ96KR1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZFRQ96KR1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZFRQ96KR1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZFRQ96KR1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZFRQ96KR1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZFRQ96KR1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZFRQ96KR1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZFRQ96KR1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZFRQ96KR1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZFRQ96KR1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZFRQ96KR1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZFRQ96KR1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZFRQ96KR1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZFRQ96KR1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZFRQ96KR1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZFRQ96KR1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZFRQ96KR1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZFRQ96KR1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZFRQ96KR1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZFRQ96KR1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZFRQ96KR1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZFRQ96KR1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZFRQ96KR1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZFRQ96KR1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZFRQ96KR1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZFRQ96KR1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZFRQ96KR1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZFRQ96KR1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZFRQ96KR1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZFRQ96KR1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZFRQ96KR1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZFRQ96KR1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZFRQ96KR1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZFRQ96KR1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZFRQ96KR1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZFRQ96KR1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZFRQ96KR1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZFRQ96KR1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZFRQ96KR1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZFRQ96KR1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZFRQ96KR1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZFRQ96KR1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZFRQ96KR1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZFRQ96KR1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZFRQ96KR1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ZFRQ96KR1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZFRQ96KR1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZFRQ96KR1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZFRQ96KR1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZFRQ96KR1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZFRQ96KR1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZFRQ96KR1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZFRQ96KR1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZFRQ96KR1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZFRQ96KR1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZFRQ96KR1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZFRQ96KR1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZFRQ96KR1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZFRQ96KR1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZFRQ96KR1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZFRQ96KR1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZFRQ96KR1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZFRQ96KR1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZFRQ96KR1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZFRQ96KR1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZFRQ96KR1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZFRQ96KR1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZFRQ96KR1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZFRQ96KR1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZFRQ96KR1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZFRQ96KR1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ZFRQ96KR1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ZFRQ96KR1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ZFRQ96KR1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZFRQ96KR1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZFRQ96KR1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZFRQ96KR1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZFRQ96KR1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZFRQ96KR1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZFRQ96KR1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZFRQ96KR1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZFRQ96KR1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZFRQ96KR1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZFRQ96KR1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms