Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
NEURL4Q96JN8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
NEURL4Q96JN8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
NEURL4Q96JN8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.8■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NEURL4Q96JN8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NEURL4Q96JN8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NEURL4Q96JN8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NEURL4Q96JN8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NEURL4Q96JN8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NEURL4Q96JN8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NEURL4Q96JN8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.62■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms