Protein–RNA interactions for Protein: Q96HC4

PDLIM5, PDZ and LIM domain protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM5Q96HC4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDLIM5Q96HC4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM5Q96HC4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM5Q96HC4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM5Q96HC4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM5Q96HC4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDLIM5Q96HC4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDLIM5Q96HC4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDLIM5Q96HC4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDLIM5Q96HC4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM5Q96HC4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM5Q96HC4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM5Q96HC4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM5Q96HC4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM5Q96HC4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM5Q96HC4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM5Q96HC4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM5Q96HC4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM5Q96HC4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM5Q96HC4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDLIM5Q96HC4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDLIM5Q96HC4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDLIM5Q96HC4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDLIM5Q96HC4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDLIM5Q96HC4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDLIM5Q96HC4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDLIM5Q96HC4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDLIM5Q96HC4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDLIM5Q96HC4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDLIM5Q96HC4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDLIM5Q96HC4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDLIM5Q96HC4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDLIM5Q96HC4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDLIM5Q96HC4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDLIM5Q96HC4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDLIM5Q96HC4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDLIM5Q96HC4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDLIM5Q96HC4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDLIM5Q96HC4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDLIM5Q96HC4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDLIM5Q96HC4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDLIM5Q96HC4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PDLIM5Q96HC4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDLIM5Q96HC4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDLIM5Q96HC4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDLIM5Q96HC4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDLIM5Q96HC4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDLIM5Q96HC4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDLIM5Q96HC4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDLIM5Q96HC4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDLIM5Q96HC4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDLIM5Q96HC4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDLIM5Q96HC4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDLIM5Q96HC4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDLIM5Q96HC4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PDLIM5Q96HC4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDLIM5Q96HC4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDLIM5Q96HC4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDLIM5Q96HC4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDLIM5Q96HC4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDLIM5Q96HC4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDLIM5Q96HC4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDLIM5Q96HC4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDLIM5Q96HC4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDLIM5Q96HC4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDLIM5Q96HC4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDLIM5Q96HC4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDLIM5Q96HC4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDLIM5Q96HC4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDLIM5Q96HC4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDLIM5Q96HC4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDLIM5Q96HC4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDLIM5Q96HC4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDLIM5Q96HC4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDLIM5Q96HC4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDLIM5Q96HC4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDLIM5Q96HC4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDLIM5Q96HC4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms