Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLUAP1Q96AJ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLUAP1Q96AJ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLUAP1Q96AJ1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLUAP1Q96AJ1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLUAP1Q96AJ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLUAP1Q96AJ1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLUAP1Q96AJ1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLUAP1Q96AJ1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLUAP1Q96AJ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLUAP1Q96AJ1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLUAP1Q96AJ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CLUAP1Q96AJ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLUAP1Q96AJ1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLUAP1Q96AJ1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLUAP1Q96AJ1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLUAP1Q96AJ1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLUAP1Q96AJ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLUAP1Q96AJ1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLUAP1Q96AJ1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLUAP1Q96AJ1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLUAP1Q96AJ1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CLUAP1Q96AJ1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLUAP1Q96AJ1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CLUAP1Q96AJ1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CLUAP1Q96AJ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLUAP1Q96AJ1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLUAP1Q96AJ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLUAP1Q96AJ1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLUAP1Q96AJ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLUAP1Q96AJ1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLUAP1Q96AJ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLUAP1Q96AJ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CLUAP1Q96AJ1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLUAP1Q96AJ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLUAP1Q96AJ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLUAP1Q96AJ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLUAP1Q96AJ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLUAP1Q96AJ1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLUAP1Q96AJ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLUAP1Q96AJ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLUAP1Q96AJ1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLUAP1Q96AJ1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CLUAP1Q96AJ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLUAP1Q96AJ1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLUAP1Q96AJ1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLUAP1Q96AJ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CLUAP1Q96AJ1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLUAP1Q96AJ1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLUAP1Q96AJ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLUAP1Q96AJ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLUAP1Q96AJ1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLUAP1Q96AJ1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLUAP1Q96AJ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLUAP1Q96AJ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLUAP1Q96AJ1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLUAP1Q96AJ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLUAP1Q96AJ1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLUAP1Q96AJ1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLUAP1Q96AJ1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLUAP1Q96AJ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLUAP1Q96AJ1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLUAP1Q96AJ1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CLUAP1Q96AJ1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLUAP1Q96AJ1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLUAP1Q96AJ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLUAP1Q96AJ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLUAP1Q96AJ1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLUAP1Q96AJ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CLUAP1Q96AJ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLUAP1Q96AJ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLUAP1Q96AJ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLUAP1Q96AJ1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLUAP1Q96AJ1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLUAP1Q96AJ1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLUAP1Q96AJ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CLUAP1Q96AJ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLUAP1Q96AJ1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLUAP1Q96AJ1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLUAP1Q96AJ1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms