Protein–RNA interactions for Protein: Q92583

CCL17, C-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL17Q92583 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCL17Q92583 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL17Q92583 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL17Q92583 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL17Q92583 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms