Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TSC1Q92574 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TSC1Q92574 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSC1Q92574 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSC1Q92574 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSC1Q92574 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSC1Q92574 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TSC1Q92574 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSC1Q92574 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSC1Q92574 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSC1Q92574 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSC1Q92574 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSC1Q92574 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSC1Q92574 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSC1Q92574 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSC1Q92574 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSC1Q92574 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSC1Q92574 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSC1Q92574 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSC1Q92574 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSC1Q92574 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSC1Q92574 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSC1Q92574 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSC1Q92574 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSC1Q92574 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSC1Q92574 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSC1Q92574 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSC1Q92574 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSC1Q92574 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSC1Q92574 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSC1Q92574 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSC1Q92574 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSC1Q92574 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSC1Q92574 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSC1Q92574 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSC1Q92574 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSC1Q92574 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSC1Q92574 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSC1Q92574 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSC1Q92574 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSC1Q92574 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSC1Q92574 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSC1Q92574 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TSC1Q92574 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TSC1Q92574 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSC1Q92574 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSC1Q92574 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSC1Q92574 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSC1Q92574 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSC1Q92574 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSC1Q92574 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSC1Q92574 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSC1Q92574 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSC1Q92574 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSC1Q92574 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSC1Q92574 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSC1Q92574 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSC1Q92574 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSC1Q92574 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSC1Q92574 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSC1Q92574 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSC1Q92574 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSC1Q92574 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSC1Q92574 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSC1Q92574 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSC1Q92574 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSC1Q92574 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSC1Q92574 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TSC1Q92574 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSC1Q92574 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSC1Q92574 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSC1Q92574 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSC1Q92574 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSC1Q92574 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSC1Q92574 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSC1Q92574 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSC1Q92574 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSC1Q92574 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSC1Q92574 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSC1Q92574 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSC1Q92574 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms