Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM9SF4Q92544 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM9SF4Q92544 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TM9SF4Q92544 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TM9SF4Q92544 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM9SF4Q92544 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF4Q92544 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms