Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCOLN3Q8TDD5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCOLN3Q8TDD5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MCOLN3Q8TDD5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCOLN3Q8TDD5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCOLN3Q8TDD5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCOLN3Q8TDD5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCOLN3Q8TDD5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCOLN3Q8TDD5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCOLN3Q8TDD5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCOLN3Q8TDD5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCOLN3Q8TDD5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCOLN3Q8TDD5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCOLN3Q8TDD5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCOLN3Q8TDD5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCOLN3Q8TDD5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCOLN3Q8TDD5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MCOLN3Q8TDD5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCOLN3Q8TDD5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCOLN3Q8TDD5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCOLN3Q8TDD5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCOLN3Q8TDD5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCOLN3Q8TDD5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCOLN3Q8TDD5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCOLN3Q8TDD5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCOLN3Q8TDD5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCOLN3Q8TDD5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCOLN3Q8TDD5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MCOLN3Q8TDD5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCOLN3Q8TDD5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCOLN3Q8TDD5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCOLN3Q8TDD5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCOLN3Q8TDD5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 325.7 ms