Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFK1

GJC3, Gap junction gamma-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC3Q8NFK1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GJC3Q8NFK1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJC3Q8NFK1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJC3Q8NFK1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJC3Q8NFK1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJC3Q8NFK1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJC3Q8NFK1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJC3Q8NFK1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJC3Q8NFK1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJC3Q8NFK1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC3Q8NFK1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC3Q8NFK1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC3Q8NFK1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC3Q8NFK1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJC3Q8NFK1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJC3Q8NFK1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJC3Q8NFK1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJC3Q8NFK1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJC3Q8NFK1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC3Q8NFK1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJC3Q8NFK1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJC3Q8NFK1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJC3Q8NFK1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GJC3Q8NFK1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJC3Q8NFK1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GJC3Q8NFK1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJC3Q8NFK1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJC3Q8NFK1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJC3Q8NFK1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJC3Q8NFK1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJC3Q8NFK1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJC3Q8NFK1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJC3Q8NFK1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJC3Q8NFK1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJC3Q8NFK1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJC3Q8NFK1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJC3Q8NFK1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJC3Q8NFK1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms