Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POMGNT2Q8NAT1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POMGNT2Q8NAT1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POMGNT2Q8NAT1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POMGNT2Q8NAT1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POMGNT2Q8NAT1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POMGNT2Q8NAT1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POMGNT2Q8NAT1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
POMGNT2Q8NAT1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POMGNT2Q8NAT1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POMGNT2Q8NAT1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POMGNT2Q8NAT1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POMGNT2Q8NAT1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POMGNT2Q8NAT1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POMGNT2Q8NAT1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POMGNT2Q8NAT1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POMGNT2Q8NAT1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POMGNT2Q8NAT1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POMGNT2Q8NAT1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POMGNT2Q8NAT1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POMGNT2Q8NAT1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POMGNT2Q8NAT1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POMGNT2Q8NAT1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POMGNT2Q8NAT1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POMGNT2Q8NAT1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POMGNT2Q8NAT1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POMGNT2Q8NAT1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POMGNT2Q8NAT1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms