Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F8

ZNF454, Zinc finger protein 454, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF454Q8N9F8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF454Q8N9F8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF454Q8N9F8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF454Q8N9F8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF454Q8N9F8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF454Q8N9F8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF454Q8N9F8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF454Q8N9F8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF454Q8N9F8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF454Q8N9F8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF454Q8N9F8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF454Q8N9F8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF454Q8N9F8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF454Q8N9F8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF454Q8N9F8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF454Q8N9F8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF454Q8N9F8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF454Q8N9F8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF454Q8N9F8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF454Q8N9F8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF454Q8N9F8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF454Q8N9F8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF454Q8N9F8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF454Q8N9F8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF454Q8N9F8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF454Q8N9F8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF454Q8N9F8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF454Q8N9F8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF454Q8N9F8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF454Q8N9F8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF454Q8N9F8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF454Q8N9F8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF454Q8N9F8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF454Q8N9F8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF454Q8N9F8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF454Q8N9F8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms