Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7U6

EFHB, EF-hand domain-containing family member B, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHBQ8N7U6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EFHBQ8N7U6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EFHBQ8N7U6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EFHBQ8N7U6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFHBQ8N7U6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFHBQ8N7U6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFHBQ8N7U6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EFHBQ8N7U6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EFHBQ8N7U6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EFHBQ8N7U6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EFHBQ8N7U6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EFHBQ8N7U6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFHBQ8N7U6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFHBQ8N7U6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFHBQ8N7U6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EFHBQ8N7U6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EFHBQ8N7U6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EFHBQ8N7U6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EFHBQ8N7U6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFHBQ8N7U6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFHBQ8N7U6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EFHBQ8N7U6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFHBQ8N7U6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFHBQ8N7U6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFHBQ8N7U6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFHBQ8N7U6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFHBQ8N7U6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFHBQ8N7U6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFHBQ8N7U6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFHBQ8N7U6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFHBQ8N7U6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFHBQ8N7U6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFHBQ8N7U6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFHBQ8N7U6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFHBQ8N7U6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFHBQ8N7U6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFHBQ8N7U6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EFHBQ8N7U6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFHBQ8N7U6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFHBQ8N7U6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFHBQ8N7U6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFHBQ8N7U6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EFHBQ8N7U6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFHBQ8N7U6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFHBQ8N7U6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFHBQ8N7U6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
EFHBQ8N7U6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFHBQ8N7U6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFHBQ8N7U6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFHBQ8N7U6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFHBQ8N7U6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFHBQ8N7U6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFHBQ8N7U6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFHBQ8N7U6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EFHBQ8N7U6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EFHBQ8N7U6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EFHBQ8N7U6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EFHBQ8N7U6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFHBQ8N7U6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms