Protein–RNA interactions for Protein: Q8N468

MFSD4A, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4AQ8N468 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD4AQ8N468 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD4AQ8N468 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD4AQ8N468 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD4AQ8N468 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD4AQ8N468 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD4AQ8N468 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD4AQ8N468 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD4AQ8N468 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD4AQ8N468 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD4AQ8N468 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MFSD4AQ8N468 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD4AQ8N468 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MFSD4AQ8N468 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD4AQ8N468 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD4AQ8N468 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD4AQ8N468 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD4AQ8N468 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD4AQ8N468 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD4AQ8N468 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD4AQ8N468 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD4AQ8N468 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD4AQ8N468 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD4AQ8N468 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD4AQ8N468 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms