Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXA5

SPACA3, Sperm acrosome membrane-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA3Q8IXA5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPACA3Q8IXA5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPACA3Q8IXA5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPACA3Q8IXA5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPACA3Q8IXA5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPACA3Q8IXA5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPACA3Q8IXA5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPACA3Q8IXA5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPACA3Q8IXA5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPACA3Q8IXA5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPACA3Q8IXA5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPACA3Q8IXA5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPACA3Q8IXA5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPACA3Q8IXA5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPACA3Q8IXA5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPACA3Q8IXA5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPACA3Q8IXA5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPACA3Q8IXA5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPACA3Q8IXA5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPACA3Q8IXA5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPACA3Q8IXA5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPACA3Q8IXA5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPACA3Q8IXA5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPACA3Q8IXA5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPACA3Q8IXA5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPACA3Q8IXA5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPACA3Q8IXA5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPACA3Q8IXA5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPACA3Q8IXA5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPACA3Q8IXA5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPACA3Q8IXA5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPACA3Q8IXA5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPACA3Q8IXA5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPACA3Q8IXA5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPACA3Q8IXA5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPACA3Q8IXA5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPACA3Q8IXA5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPACA3Q8IXA5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPACA3Q8IXA5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPACA3Q8IXA5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPACA3Q8IXA5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPACA3Q8IXA5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPACA3Q8IXA5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPACA3Q8IXA5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPACA3Q8IXA5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPACA3Q8IXA5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPACA3Q8IXA5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPACA3Q8IXA5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPACA3Q8IXA5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPACA3Q8IXA5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPACA3Q8IXA5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPACA3Q8IXA5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPACA3Q8IXA5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms