Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRLF3Q8IUI8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRLF3Q8IUI8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRLF3Q8IUI8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CRLF3Q8IUI8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRLF3Q8IUI8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRLF3Q8IUI8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRLF3Q8IUI8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRLF3Q8IUI8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms