Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD7

FAM90A1, Protein FAM90A1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A1Q86YD7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM90A1Q86YD7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM90A1Q86YD7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM90A1Q86YD7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM90A1Q86YD7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM90A1Q86YD7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM90A1Q86YD7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM90A1Q86YD7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM90A1Q86YD7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM90A1Q86YD7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM90A1Q86YD7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM90A1Q86YD7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM90A1Q86YD7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM90A1Q86YD7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM90A1Q86YD7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM90A1Q86YD7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM90A1Q86YD7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM90A1Q86YD7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A1Q86YD7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM90A1Q86YD7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms