Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SFR1Q86XK3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SFR1Q86XK3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SFR1Q86XK3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SFR1Q86XK3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SFR1Q86XK3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SFR1Q86XK3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SFR1Q86XK3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SFR1Q86XK3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SFR1Q86XK3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SFR1Q86XK3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SFR1Q86XK3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SFR1Q86XK3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SFR1Q86XK3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SFR1Q86XK3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SFR1Q86XK3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SFR1Q86XK3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SFR1Q86XK3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SFR1Q86XK3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SFR1Q86XK3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SFR1Q86XK3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SFR1Q86XK3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SFR1Q86XK3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms