Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDPD3Q7L5L3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDPD3Q7L5L3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDPD3Q7L5L3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD3Q7L5L3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPD3Q7L5L3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPD3Q7L5L3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDPD3Q7L5L3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDPD3Q7L5L3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPD3Q7L5L3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPD3Q7L5L3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPD3Q7L5L3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPD3Q7L5L3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPD3Q7L5L3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPD3Q7L5L3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPD3Q7L5L3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDPD3Q7L5L3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDPD3Q7L5L3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD3Q7L5L3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD3Q7L5L3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GDPD3Q7L5L3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDPD3Q7L5L3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDPD3Q7L5L3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDPD3Q7L5L3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDPD3Q7L5L3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD3Q7L5L3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD3Q7L5L3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD3Q7L5L3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPD3Q7L5L3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD3Q7L5L3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD3Q7L5L3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPD3Q7L5L3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPD3Q7L5L3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPD3Q7L5L3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPD3Q7L5L3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPD3Q7L5L3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms