Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GDPD3Q7L5L3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GDPD3Q7L5L3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GDPD3Q7L5L3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GDPD3Q7L5L3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GDPD3Q7L5L3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GDPD3Q7L5L3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GDPD3Q7L5L3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GDPD3Q7L5L3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GDPD3Q7L5L3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GDPD3Q7L5L3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GDPD3Q7L5L3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GDPD3Q7L5L3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GDPD3Q7L5L3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GDPD3Q7L5L3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GDPD3Q7L5L3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GDPD3Q7L5L3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GDPD3Q7L5L3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GDPD3Q7L5L3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDPD3Q7L5L3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD3Q7L5L3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GDPD3Q7L5L3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GDPD3Q7L5L3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GDPD3Q7L5L3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GDPD3Q7L5L3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GDPD3Q7L5L3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GDPD3Q7L5L3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDPD3Q7L5L3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GDPD3Q7L5L3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GDPD3Q7L5L3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GDPD3Q7L5L3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDPD3Q7L5L3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDPD3Q7L5L3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GDPD3Q7L5L3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GDPD3Q7L5L3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDPD3Q7L5L3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDPD3Q7L5L3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GDPD3Q7L5L3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDPD3Q7L5L3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDPD3Q7L5L3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDPD3Q7L5L3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDPD3Q7L5L3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GDPD3Q7L5L3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GDPD3Q7L5L3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GDPD3Q7L5L3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDPD3Q7L5L3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDPD3Q7L5L3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDPD3Q7L5L3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
GDPD3Q7L5L3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GDPD3Q7L5L3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GDPD3Q7L5L3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDPD3Q7L5L3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GDPD3Q7L5L3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GDPD3Q7L5L3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GDPD3Q7L5L3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDPD3Q7L5L3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GDPD3Q7L5L3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GDPD3Q7L5L3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GDPD3Q7L5L3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GDPD3Q7L5L3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GDPD3Q7L5L3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GDPD3Q7L5L3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GDPD3Q7L5L3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDPD3Q7L5L3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDPD3Q7L5L3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDPD3Q7L5L3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDPD3Q7L5L3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDPD3Q7L5L3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDPD3Q7L5L3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDPD3Q7L5L3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GDPD3Q7L5L3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GDPD3Q7L5L3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDPD3Q7L5L3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDPD3Q7L5L3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDPD3Q7L5L3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GDPD3Q7L5L3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GDPD3Q7L5L3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GDPD3Q7L5L3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDPD3Q7L5L3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDPD3Q7L5L3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDPD3Q7L5L3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDPD3Q7L5L3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDPD3Q7L5L3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDPD3Q7L5L3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDPD3Q7L5L3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDPD3Q7L5L3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDPD3Q7L5L3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDPD3Q7L5L3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDPD3Q7L5L3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDPD3Q7L5L3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDPD3Q7L5L3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDPD3Q7L5L3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDPD3Q7L5L3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDPD3Q7L5L3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDPD3Q7L5L3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDPD3Q7L5L3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDPD3Q7L5L3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDPD3Q7L5L3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDPD3Q7L5L3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDPD3Q7L5L3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms