Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN12Q6ZSI9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN12Q6ZSI9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN12Q6ZSI9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN12Q6ZSI9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN12Q6ZSI9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN12Q6ZSI9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAPN12Q6ZSI9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN12Q6ZSI9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAPN12Q6ZSI9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN12Q6ZSI9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN12Q6ZSI9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN12Q6ZSI9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN12Q6ZSI9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN12Q6ZSI9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN12Q6ZSI9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN12Q6ZSI9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN12Q6ZSI9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN12Q6ZSI9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN12Q6ZSI9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN12Q6ZSI9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN12Q6ZSI9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN12Q6ZSI9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN12Q6ZSI9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN12Q6ZSI9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN12Q6ZSI9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN12Q6ZSI9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN12Q6ZSI9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN12Q6ZSI9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPN12Q6ZSI9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAPN12Q6ZSI9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPN12Q6ZSI9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPN12Q6ZSI9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN12Q6ZSI9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN12Q6ZSI9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN12Q6ZSI9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN12Q6ZSI9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN12Q6ZSI9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN12Q6ZSI9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN12Q6ZSI9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN12Q6ZSI9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN12Q6ZSI9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN12Q6ZSI9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN12Q6ZSI9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN12Q6ZSI9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN12Q6ZSI9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms