Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SRCAPQ6ZRS2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SRCAPQ6ZRS2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SRCAPQ6ZRS2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SRCAPQ6ZRS2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SRCAPQ6ZRS2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SRCAPQ6ZRS2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SRCAPQ6ZRS2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SRCAPQ6ZRS2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SRCAPQ6ZRS2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SRCAPQ6ZRS2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SRCAPQ6ZRS2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SRCAPQ6ZRS2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SRCAPQ6ZRS2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SRCAPQ6ZRS2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SRCAPQ6ZRS2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SRCAPQ6ZRS2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SRCAPQ6ZRS2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SRCAPQ6ZRS2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
SRCAPQ6ZRS2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SRCAPQ6ZRS2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SRCAPQ6ZRS2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SRCAPQ6ZRS2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SRCAPQ6ZRS2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SRCAPQ6ZRS2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SRCAPQ6ZRS2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SRCAPQ6ZRS2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SRCAPQ6ZRS2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SRCAPQ6ZRS2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SRCAPQ6ZRS2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SRCAPQ6ZRS2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SRCAPQ6ZRS2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SRCAPQ6ZRS2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SRCAPQ6ZRS2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
SRCAPQ6ZRS2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SRCAPQ6ZRS2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SRCAPQ6ZRS2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SRCAPQ6ZRS2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SRCAPQ6ZRS2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
SRCAPQ6ZRS2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SRCAPQ6ZRS2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SRCAPQ6ZRS2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SRCAPQ6ZRS2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SRCAPQ6ZRS2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SRCAPQ6ZRS2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SRCAPQ6ZRS2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
SRCAPQ6ZRS2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SRCAPQ6ZRS2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SRCAPQ6ZRS2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SRCAPQ6ZRS2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SRCAPQ6ZRS2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SRCAPQ6ZRS2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SRCAPQ6ZRS2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SRCAPQ6ZRS2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SRCAPQ6ZRS2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SRCAPQ6ZRS2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SRCAPQ6ZRS2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SRCAPQ6ZRS2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SRCAPQ6ZRS2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SRCAPQ6ZRS2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SRCAPQ6ZRS2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SRCAPQ6ZRS2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SRCAPQ6ZRS2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SRCAPQ6ZRS2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SRCAPQ6ZRS2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SRCAPQ6ZRS2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
SRCAPQ6ZRS2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SRCAPQ6ZRS2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SRCAPQ6ZRS2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SRCAPQ6ZRS2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SRCAPQ6ZRS2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SRCAPQ6ZRS2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SRCAPQ6ZRS2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SRCAPQ6ZRS2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SRCAPQ6ZRS2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SRCAPQ6ZRS2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SRCAPQ6ZRS2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SRCAPQ6ZRS2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SRCAPQ6ZRS2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SRCAPQ6ZRS2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
SRCAPQ6ZRS2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SRCAPQ6ZRS2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SRCAPQ6ZRS2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SRCAPQ6ZRS2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SRCAPQ6ZRS2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SRCAPQ6ZRS2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SRCAPQ6ZRS2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SRCAPQ6ZRS2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SRCAPQ6ZRS2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SRCAPQ6ZRS2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SRCAPQ6ZRS2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SRCAPQ6ZRS2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SRCAPQ6ZRS2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SRCAPQ6ZRS2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SRCAPQ6ZRS2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
SRCAPQ6ZRS2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SRCAPQ6ZRS2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SRCAPQ6ZRS2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms