Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRP0

PRR23C, Proline-rich protein 23C, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23CQ6ZRP0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRR23CQ6ZRP0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRR23CQ6ZRP0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRR23CQ6ZRP0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRR23CQ6ZRP0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR23CQ6ZRP0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR23CQ6ZRP0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR23CQ6ZRP0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR23CQ6ZRP0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR23CQ6ZRP0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR23CQ6ZRP0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR23CQ6ZRP0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR23CQ6ZRP0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR23CQ6ZRP0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR23CQ6ZRP0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRR23CQ6ZRP0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRR23CQ6ZRP0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRR23CQ6ZRP0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRR23CQ6ZRP0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRR23CQ6ZRP0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRR23CQ6ZRP0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRR23CQ6ZRP0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRR23CQ6ZRP0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRR23CQ6ZRP0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRR23CQ6ZRP0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRR23CQ6ZRP0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRR23CQ6ZRP0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRR23CQ6ZRP0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PRR23CQ6ZRP0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRR23CQ6ZRP0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRR23CQ6ZRP0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRR23CQ6ZRP0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRR23CQ6ZRP0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRR23CQ6ZRP0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRR23CQ6ZRP0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRR23CQ6ZRP0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRR23CQ6ZRP0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRR23CQ6ZRP0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PRR23CQ6ZRP0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRR23CQ6ZRP0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRR23CQ6ZRP0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRR23CQ6ZRP0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRR23CQ6ZRP0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRR23CQ6ZRP0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRR23CQ6ZRP0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRR23CQ6ZRP0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRR23CQ6ZRP0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRR23CQ6ZRP0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRR23CQ6ZRP0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRR23CQ6ZRP0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRR23CQ6ZRP0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRR23CQ6ZRP0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRR23CQ6ZRP0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRR23CQ6ZRP0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRR23CQ6ZRP0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRR23CQ6ZRP0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRR23CQ6ZRP0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRR23CQ6ZRP0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRR23CQ6ZRP0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRR23CQ6ZRP0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRR23CQ6ZRP0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRR23CQ6ZRP0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRR23CQ6ZRP0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRR23CQ6ZRP0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRR23CQ6ZRP0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRR23CQ6ZRP0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRR23CQ6ZRP0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRR23CQ6ZRP0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRR23CQ6ZRP0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRR23CQ6ZRP0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRR23CQ6ZRP0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRR23CQ6ZRP0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRR23CQ6ZRP0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRR23CQ6ZRP0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRR23CQ6ZRP0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRR23CQ6ZRP0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRR23CQ6ZRP0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRR23CQ6ZRP0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRR23CQ6ZRP0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRR23CQ6ZRP0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRR23CQ6ZRP0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRR23CQ6ZRP0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRR23CQ6ZRP0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms